Istnieje wiele metod leczenia oraz grup leków uśmierzających objawy kataru siennego, ale najlepszą obroną dla chorego jest eliminacja alergenu z otoczenia. Dopiero gdy alergen występuje powszechnie i nie może zostać usunięty ze środowiska życia pacjenta, wprowadza się leczenie – najlepszą metodą jest ta, która zapobiega występowaniu objawów (a w dalszej kolejności ta, która leczy rozwinięte schorzenia).
W „odblokowaniu” nosa pomagają leki zmniejszające przekrwienie śluzówek, tzw. dekongestanty. Pomagają one w ostrym napadzie kataru, jednak nie wolno ich stosować długo – mogą wtedy nasilać objawy, zamiast im przeciwdziałać. Leki przeciwhistaminowe oraz dekongestanty mogą wchodzić w interakcje z preparatami stosowanymi w chorobach serca, antybiotykiem erytromycyną oraz środkiem przeciwgrzybiczym – ketokonazolem. Jeśli zatem chory zażywa jeden z tych specyfików, musi o tym poinformować lekarza, który zadecyduje o dawkowaniu i wyborze najlepszego w danej sytuacji preparatu. W przypadku znacznego nasilenia objawów podaje się leki przeciwhistaminowe.
Pomocne w leczeniu kataru siennego są krople lub aerozole do nosa, zawierające leki obkurczające śluzówkę lub przeciwhistaminowe. Pomagają zwalczać pieczenie i świąd oraz udrażniają nozdrza. Czasami zaleca się występujące w postaci aerozolów donosowych preparaty kromoglikatów, które, jeśli są podawane regularnie, kilka razy dziennie, zapobiegają objawom alergii. Przy nasilonych objawach kataru siennego stosuje się miejscowo, podawane w formie kropli lub w aerozolu, preparaty glikokortykosteroidów.
Nie wolno nadużywać kropli do nosa, mogą bowiem uzależniać i powodować powikłania. Leki zawierające aspirynę mogą nasilać objawy nieżytu nosa i dlatego nie należy ich stosować.
Inną linią terapii jest immunoterapia, określana także jako odczulanie. Podstawę stanowi seria zastrzyków, w których chorym podaje się podskórnie we wzrastających dawkach mieszankę uczulających ich alergenów. Celem takiego działania jest wywołanie zobojętnienia ustroju lub odczulenie chorego na alergeny wziewne. Skuteczność tej metody leczenia oceniana jest na 75% – taka liczba chorych może pozbyć się objawów kataru siennego po odczulaniu. Pełen cykl odczulania trwa od roku do 5 lat.
Wiele terapii naturalnych może pomóc opanować objawy i służyć jako środek zapobiegawczy.
Inhalacje olejku z eukaliptusa (Eucalyptus globulus), mięty pieprzowej (Mentha piperita) albo hizopu (Hyssopus officinalis) mogą złagodzić podrażnienie i ból zatok.